A Coleção Documental inclui cerca de 12.882 documentos do IBCCF (Cartas, telegramas, portarias, cartões de agradecimentos, pareceres, memorandos, recibos, ofício circular, convite, cartão postal). Esses documentos relacionados ao IBCCF foram digitalizados pela COC (Casa de Oswaldo Cruz – Fiocruz).
Também faz parte da coleção, documentos pertenceram a pesquisadores do Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho e que foram doados ao EMCCF.
Coleção IBCCF
Coleção Carlos Chagas Filho
Coleção Cezar Antônio Elias
Coleção Aristides Pacheco Leão
Coleção Darcy Fontoura de Almeida
Em relação ao acervo documental, ações de Conservação Preventiva são realizadas para garantir sua salvaguarda. Tais práticas são: Substituição das caixas documentais de papel ácido por caixas em papel Acid Free Polionda, dispostas horizontalmente afim de otimizar o espaço do arquivo. Dentro destas caixas, contém envelopes cruz confeccionais com papel Acid Free, etiquetados com adesivos neutros, identificando a ordem cronológica dos documentos. Além disso, é necessário fazer o controle de umidade e temperatura do local regularmente com dispositivos de medição.